Siklus asam sitrat pada metabolisme karbohidrat, lipid dan protein

Siklus asam sitrat dimulai dengan satu molekul asetil-KoA bereaksi dengan satu molekul H₂O, melepaskan gugus koenzim-A, dan mendonorkan dua atom karbon yang tersisa dalam bentuk gugus asetil kepada asam oksaloasetat yang memiliki molekul dengan empat atom karbon, hingga menghasilkan asam sitrat dengan enam atom karbon.

	Substrat	Produk	Enzim	Reaksi	Keterangan
1	Oksaloasetat + Asetil-KoA	Asam sitrat + CoA-SH + H+	Sitrat sintase	Hidrolisis	Setelah enzim sitrat sintase melepaskan satu ion H+ dari molekul CH3 gugus asetil dari asetil-KoA, molekul CH2- pada gugus asetil tersebut akan bereaksi dengan asam oksaloasetat membentuk metabolit S-sitril-KoA. Reaksi hidrolisis yang terjadi selanjutnya pada gugus koenzim-A akan mendorong reaksi hingga menghasilkan tiga jenis produk.
2	Asam sitrat	cis-Asonitat + H2O	Asonitase	Dehidrasi	Reaksi isomerisasi terjadi dengan dua tahap, enzim asonitase akan melepaskan gugus air dari asam sitrat membentuk metabolit cis-Asonitat, kemudian terjadi penambahan kembali molekul air dengan pergeseran lokasi gugus hidroksil dan menghasilkan isomer asam sitrat.
3	cis-Asonitat + H2O	Isositrat		Hidrasi
4	Isositrat + NAD+	Oksalosuksinat + NADH + H +	Isositrat dehidrogenase	Oksidasi	Enzim isositrat dehidrogenase bersama dengan koenzim NAD+ akan mengubah gugus karboksil menjadi gugus karbonil, membentuk senyawa intermediat yang disebut oksalosuksinat. Eksitasi oleh ion H+ akan menyebabkan oksalosuksinat melepaskan gugus COO- yang tidak stabil dan membentuk senyawa CO2.
5	Oksalosuksinat	Ketoglutarat-α + CO2		Dekarboksilasi
6	Ketoglutarat-α + NAD+ + CoA-SH	Suksinil-KoA + NADH + H+ + CO2	Ketoglutarat-α dehidrogenase	Dekarboksilasi	Kompleks dehidrogenase ketoglutarat-alfa mirip kompleks piruvat dehidrogenase yang menjadi enzim pada transformasi asam piruvat menjadi asetil-KoA. Bersama dengan koenzim NAD+ akan mempercepat oksidasi yang membentuk koenzim baru, disebut suksinil-KoA, yang memiliki ikatan tioester antara koenzim-A dengan gugus suksinil.
7	Suksinil-KoA + GDP + Pi + H2O	Suksinat + CoA-SH + GTP	Suksinil-KoA sintetase	fosforilasi substrat	Senyawa Pi akan menggantikan gugus CoA pada suksinat, kemudian didonorkan ke GDP untuk membentuk GTP. Pada bakteri dan tumbuhan, gugus Pi akan didonorkan ke ADP guna menghasilkan ATP.
8	Suksinat + FAD	Fumarat + FADH2	Suksinat dehidrogenase	Oksidasi	Koenzim FAD akan menarik dua atom hidrogen dari suksinat. Reaksi ini tidak terjadi di dalam matriks mitokondria, tetapi terjadi pada antarmuka antara matriks mitokondria dan rantai transpor elektron yang disebut suksinat dehidrogenase yang melintang pada membran mitokondria bagian dalam, enzim ini sering juga disebut "kompleks II".
9	Fumarat + H2O	Malat	Fumarase	Hidrasi	Reaksi penambahan molekul air pada fumarat akan menjadi gugus hidroksil pada senyawa baru.
10	Malat + NAD+	Oksaloasetat + NADH + H+	Malat dehidrogenase	Oksidasi	Reaksi oksidasi yang terakhir akan mengubah gugus hidroksil menjadi karbonil dan menghasilkan senyawa pertama siklus sitrat, yaitu asam oksaloasetat.